贝壳通常都长在软体动物之外。贝壳最主要的功能是支撑动物体，它们可以保护动物体不被敌人吃掉，还能够保护动物体避免过分乾燥而死亡。贝壳是外套膜的边缘细胞所分泌的碳酸钙所形成的。

软体动物的血中合有大量的碳酸钙。这些碳酸钙是软体动物由水中及食物中吸收的。外套膜边缘的细胞可以将血液中的碳酸钙浓缩，并且使它们形成类似方解石和亚拉冈石的矿物结品。亚拉冈石的结晶形式便是真珠层。贝壳最先分泌形成的是外壳层，由外套膜的外部形成。外壳层形成之后，碳酸钙才在外壳层的内面，形成中壳层和内壳层。

贝壳是来自於外套膜的分泌物，成长中的贝类，肉体逐渐长大，外套就被推著向外移，分泌物就从壳口外唇及壳轴上一直叠上去，於是贝壳类就沿著螺旋方向长大。贝壳的壳是会长大的，有人误认贝壳会换壳，是因与寄居蟹混淆所致，寄居蟹乃借用贝壳为居，本身并非贝类，而属节肢动物，不能自行制造石灰质外壳，身体逐见长大，必然得时换壳，以供安身。